Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms