Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms