Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TQQ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms