Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam172aQ3TNH5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam172aQ3TNH5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms