Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms