Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms