Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uri1Q3TLD5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uri1Q3TLD5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms