Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms