Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem104Q3TB48 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem104Q3TB48 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms