Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms