Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml4Q3LRV9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms