Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prex2Q3LAC4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex2Q3LAC4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms