Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl9Q32KG4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms