Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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H2-M3Q31093 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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H2-M3Q31093 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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H2-M3Q31093 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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H2-M3Q31093 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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H2-M3Q31093 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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H2-M3Q31093 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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