Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms