Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms