Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna5Q2MKA5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms