Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms