Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1lQ2KN98 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms