Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam178bQ24JP3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam178bQ24JP3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam178bQ24JP3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam178bQ24JP3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam178bQ24JP3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam178bQ24JP3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam178bQ24JP3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms