Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms