Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cers3Q1A3B0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms