Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ptchd1Q14B62 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ptchd1Q14B62 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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