Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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VgfQ0VGU4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms