Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli2Q0VGT2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms