Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc39dQ0VF76 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc39dQ0VF76 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc39dQ0VF76 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc39dQ0VF76 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc39dQ0VF76 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms