Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col19a1Q0VF58 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col19a1Q0VF58 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms