Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms