Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h18Q0P678 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms