Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms