Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssrp1Q08943 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms