Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms