Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cnn1Q08091 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn1Q08091 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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