Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms