Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MestQ07646 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MestQ07646 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MestQ07646 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms