Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms