Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms