Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms