Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms