Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fmn1Q05860 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms