Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms