Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nf1Q04690 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nf1Q04690 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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