Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms