Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms