Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CkbQ04447 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms