Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms