Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff2Q03404 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms