Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkczQ02956 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms