Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms