Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms